Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01843 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01843 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01843 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01843 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01843 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01843 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01843 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01843 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01843 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01843 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01843 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01843 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01843 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01843 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01843 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01843 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01843 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01843 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01843 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01843 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01843 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01843 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01843 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01843 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01843 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01843 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01843 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01843 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01843 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01843 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01843 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01843 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01843 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01843 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01843 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01843 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01843 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01843 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01843 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01843 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01843 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01843 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01843 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01843 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01843 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01843 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01843 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01843 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01843 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01843 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01843 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01843 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01843 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01843 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01843 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01843 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01843 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01843 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01843 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01843 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01843 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01843 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01843 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01843 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01843 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01843 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01843 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01843 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01843 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01843 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01843 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01843 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01843 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01843 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01843 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01843 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01843 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01843 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01843 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01843 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01843 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01843 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01843 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01843 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01843 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01843 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01843 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01843 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01843 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01843 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01843 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01843 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01843 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
P01843 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01843 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01843 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01843 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01843 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01843 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms