Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01793 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01793 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01793 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01793 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01793 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01793 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01793 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01793 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01793 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01793 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
P01793 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01793 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01793 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01793 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01793 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01793 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
P01793 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
P01793 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01793 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01793 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01793 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01793 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01793 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01793 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01793 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01793 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01793 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01793 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01793 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01793 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01793 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01793 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01793 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01793 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01793 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01793 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01793 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01793 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01793 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01793 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01793 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01793 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01793 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01793 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01793 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01793 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01793 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01793 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01793 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01793 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01793 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01793 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01793 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01793 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01793 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01793 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01793 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01793 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01793 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01793 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01793 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01793 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01793 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01793 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01793 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01793 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01793 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01793 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01793 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01793 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01793 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01793 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01793 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01793 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01793 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01793 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01793 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01793 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01793 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01793 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01793 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01793 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01793 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01793 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01793 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01793 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01793 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01793 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01793 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01793 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01793 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01793 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01793 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01793 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01793 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01793 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01793 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01793 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01793 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.1 ms