Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P01641 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P01641 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01641 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01641 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01641 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P01641 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P01641 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P01641 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P01641 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P01641 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P01641 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P01641 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
P01641 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
P01641 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
P01641 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P01641 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P01641 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P01641 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
P01641 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P01641 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P01641 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P01641 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
P01641 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
P01641 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
P01641 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
P01641 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01641 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P01641 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P01641 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P01641 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P01641 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01641 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01641 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
P01641 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
P01641 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P01641 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
P01641 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
P01641 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P01641 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
P01641 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P01641 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P01641 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
P01641 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
P01641 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
P01641 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
P01641 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
P01641 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
P01641 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
P01641 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
P01641 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01641 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01641 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01641 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P01641 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
P01641 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P01641 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
P01641 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
P01641 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
P01641 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P01641 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P01641 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
P01641 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
P01641 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P01641 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P01641 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P01641 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P01641 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
P01641 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P01641 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P01641 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P01641 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P01641 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
P01641 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P01641 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
P01641 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P01641 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P01641 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P01641 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P01641 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P01641 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P01641 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P01641 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P01641 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P01641 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P01641 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P01641 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P01641 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P01641 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P01641 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P01641 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P01641 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P01641 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P01641 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P01641 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P01641 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P01641 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
P01641 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
P01641 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
P01641 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms