Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna2P01573 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifna2P01573 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifna2P01573 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifna2P01573 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna2P01573 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna2P01573 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifna2P01573 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna2P01573 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifna2P01573 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifna2P01573 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifna2P01573 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms