Protein–RNA interactions for Protein: O89016

Abcd4, ATP-binding cassette sub-family D member 4, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd4O89016 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd4O89016 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd4O89016 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd4O89016 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd4O89016 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd4O89016 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcd4O89016 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcd4O89016 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcd4O89016 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcd4O89016 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcd4O89016 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcd4O89016 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcd4O89016 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd4O89016 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcd4O89016 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcd4O89016 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcd4O89016 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcd4O89016 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcd4O89016 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd4O89016 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcd4O89016 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcd4O89016 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcd4O89016 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd4O89016 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms