Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gnpda1O88958 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gnpda1O88958 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gnpda1O88958 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gnpda1O88958 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gnpda1O88958 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gnpda1O88958 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gnpda1O88958 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gnpda1O88958 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gnpda1O88958 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gnpda1O88958 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gnpda1O88958 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gnpda1O88958 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gnpda1O88958 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gnpda1O88958 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gnpda1O88958 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gnpda1O88958 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gnpda1O88958 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gnpda1O88958 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gnpda1O88958 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gnpda1O88958 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gnpda1O88958 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gnpda1O88958 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gnpda1O88958 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gnpda1O88958 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gnpda1O88958 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gnpda1O88958 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gnpda1O88958 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gnpda1O88958 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms