Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmx1bO88609 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmx1bO88609 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmx1bO88609 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmx1bO88609 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmx1bO88609 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmx1bO88609 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmx1bO88609 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmx1bO88609 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmx1bO88609 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmx1bO88609 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmx1bO88609 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmx1bO88609 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmx1bO88609 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmx1bO88609 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmx1bO88609 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmx1bO88609 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmx1bO88609 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmx1bO88609 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms