Protein–RNA interactions for Protein: O88513

Gmnn, Geminin, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmnnO88513 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GmnnO88513 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GmnnO88513 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GmnnO88513 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GmnnO88513 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GmnnO88513 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GmnnO88513 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GmnnO88513 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GmnnO88513 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GmnnO88513 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GmnnO88513 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GmnnO88513 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GmnnO88513 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GmnnO88513 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GmnnO88513 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GmnnO88513 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GmnnO88513 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GmnnO88513 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GmnnO88513 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GmnnO88513 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GmnnO88513 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GmnnO88513 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GmnnO88513 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GmnnO88513 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GmnnO88513 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GmnnO88513 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GmnnO88513 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GmnnO88513 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GmnnO88513 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GmnnO88513 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GmnnO88513 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GmnnO88513 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GmnnO88513 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GmnnO88513 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GmnnO88513 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GmnnO88513 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GmnnO88513 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GmnnO88513 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GmnnO88513 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GmnnO88513 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GmnnO88513 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GmnnO88513 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GmnnO88513 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GmnnO88513 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GmnnO88513 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GmnnO88513 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GmnnO88513 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GmnnO88513 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GmnnO88513 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GmnnO88513 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GmnnO88513 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GmnnO88513 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GmnnO88513 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms