Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tnnt1O88346 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Tnnt1O88346 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tnnt1O88346 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Tnnt1O88346 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Tnnt1O88346 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tnnt1O88346 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tnnt1O88346 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Tnnt1O88346 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Tnnt1O88346 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Tnnt1O88346 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Tnnt1O88346 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tnnt1O88346 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tnnt1O88346 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tnnt1O88346 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tnnt1O88346 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Tnnt1O88346 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Tnnt1O88346 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Tnnt1O88346 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Tnnt1O88346 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Tnnt1O88346 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tnnt1O88346 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Tnnt1O88346 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tnnt1O88346 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tnnt1O88346 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tnnt1O88346 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tnnt1O88346 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Tnnt1O88346 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Tnnt1O88346 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tnnt1O88346 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tnnt1O88346 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tnnt1O88346 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Tnnt1O88346 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tnnt1O88346 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tnnt1O88346 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tnnt1O88346 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tnnt1O88346 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Tnnt1O88346 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tnnt1O88346 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tnnt1O88346 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tnnt1O88346 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tnnt1O88346 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tnnt1O88346 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tnnt1O88346 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tnnt1O88346 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tnnt1O88346 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tnnt1O88346 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tnnt1O88346 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tnnt1O88346 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tnnt1O88346 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tnnt1O88346 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Tnnt1O88346 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tnnt1O88346 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tnnt1O88346 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tnnt1O88346 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tnnt1O88346 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms