Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snx12O70493 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx12O70493 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx12O70493 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx12O70493 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx12O70493 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx12O70493 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx12O70493 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx12O70493 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx12O70493 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx12O70493 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx12O70493 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx12O70493 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx12O70493 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx12O70493 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx12O70493 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx12O70493 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx12O70493 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx12O70493 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx12O70493 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx12O70493 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx12O70493 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx12O70493 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx12O70493 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx12O70493 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx12O70493 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx12O70493 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx12O70493 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx12O70493 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx12O70493 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx12O70493 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx12O70493 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx12O70493 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx12O70493 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx12O70493 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx12O70493 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx12O70493 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx12O70493 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx12O70493 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx12O70493 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx12O70493 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx12O70493 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx12O70493 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx12O70493 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx12O70493 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx12O70493 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx12O70493 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx12O70493 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx12O70493 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx12O70493 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261 ms