Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hmx1O70218 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hmx1O70218 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hmx1O70218 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hmx1O70218 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hmx1O70218 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hmx1O70218 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Hmx1O70218 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hmx1O70218 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hmx1O70218 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hmx1O70218 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hmx1O70218 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hmx1O70218 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Hmx1O70218 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmx1O70218 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hmx1O70218 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hmx1O70218 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hmx1O70218 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hmx1O70218 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmx1O70218 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmx1O70218 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hmx1O70218 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hmx1O70218 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmx1O70218 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmx1O70218 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmx1O70218 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Hmx1O70218 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmx1O70218 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmx1O70218 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmx1O70218 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmx1O70218 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmx1O70218 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmx1O70218 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmx1O70218 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmx1O70218 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmx1O70218 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmx1O70218 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmx1O70218 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms