Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sigmar1O55242 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sigmar1O55242 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sigmar1O55242 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sigmar1O55242 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sigmar1O55242 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sigmar1O55242 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sigmar1O55242 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sigmar1O55242 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sigmar1O55242 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sigmar1O55242 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sigmar1O55242 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sigmar1O55242 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
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