Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChkbO55229 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ChkbO55229 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ChkbO55229 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChkbO55229 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChkbO55229 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChkbO55229 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ChkbO55229 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ChkbO55229 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ChkbO55229 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ChkbO55229 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChkbO55229 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChkbO55229 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ChkbO55229 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ChkbO55229 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ChkbO55229 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ChkbO55229 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChkbO55229 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChkbO55229 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChkbO55229 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChkbO55229 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ChkbO55229 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ChkbO55229 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ChkbO55229 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChkbO55229 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ChkbO55229 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChkbO55229 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ChkbO55229 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ChkbO55229 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ChkbO55229 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ChkbO55229 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ChkbO55229 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ChkbO55229 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ChkbO55229 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ChkbO55229 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChkbO55229 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChkbO55229 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChkbO55229 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChkbO55229 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ChkbO55229 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChkbO55229 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ChkbO55229 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ChkbO55229 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ChkbO55229 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ChkbO55229 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChkbO55229 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms