Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Supt5hO55201 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Supt5hO55201 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Supt5hO55201 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Supt5hO55201 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Supt5hO55201 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Supt5hO55201 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Supt5hO55201 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Supt5hO55201 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Supt5hO55201 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Supt5hO55201 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Supt5hO55201 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Supt5hO55201 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Supt5hO55201 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Supt5hO55201 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Supt5hO55201 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Supt5hO55201 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Supt5hO55201 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Supt5hO55201 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Supt5hO55201 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Supt5hO55201 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Supt5hO55201 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Supt5hO55201 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Supt5hO55201 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Supt5hO55201 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Supt5hO55201 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Supt5hO55201 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Supt5hO55201 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Supt5hO55201 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Supt5hO55201 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Supt5hO55201 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Supt5hO55201 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Supt5hO55201 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Supt5hO55201 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Supt5hO55201 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Supt5hO55201 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Supt5hO55201 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Supt5hO55201 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Supt5hO55201 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Supt5hO55201 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Supt5hO55201 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Supt5hO55201 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Supt5hO55201 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Supt5hO55201 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Supt5hO55201 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Supt5hO55201 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Supt5hO55201 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Supt5hO55201 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Supt5hO55201 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Supt5hO55201 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Supt5hO55201 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Supt5hO55201 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Supt5hO55201 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Supt5hO55201 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Supt5hO55201 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Supt5hO55201 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Supt5hO55201 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Supt5hO55201 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Supt5hO55201 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Supt5hO55201 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Supt5hO55201 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Supt5hO55201 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Supt5hO55201 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Supt5hO55201 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Supt5hO55201 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Supt5hO55201 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Supt5hO55201 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms