Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Sept7O55131 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Sept7O55131 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Sept7O55131 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Sept7O55131 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Sept7O55131 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Sept7O55131 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Sept7O55131 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Sept7O55131 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Sept7O55131 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Sept7O55131 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Sept7O55131 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Sept7O55131 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Sept7O55131 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Sept7O55131 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Sept7O55131 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Sept7O55131 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Sept7O55131 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Sept7O55131 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Sept7O55131 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,14■■□□□ 1,77
Sept7O55131 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Sept7O55131 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Sept7O55131 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Sept7O55131 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Sept7O55131 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Sept7O55131 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Sept7O55131 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Sept7O55131 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Sept7O55131 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Sept7O55131 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Sept7O55131 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Sept7O55131 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Sept7O55131 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Sept7O55131 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Sept7O55131 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Sept7O55131 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Sept7O55131 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Sept7O55131 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Sept7O55131 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Sept7O55131 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Sept7O55131 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Sept7O55131 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Sept7O55131 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Sept7O55131 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Sept7O55131 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Sept7O55131 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Sept7O55131 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Sept7O55131 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Sept7O55131 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Sept7O55131 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Sept7O55131 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Sept7O55131 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Sept7O55131 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Sept7O55131 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Sept7O55131 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Sept7O55131 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Sept7O55131 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Sept7O55131 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Sept7O55131 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Sept7O55131 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Sept7O55131 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Sept7O55131 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Sept7O55131 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Sept7O55131 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Sept7O55131 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Sept7O55131 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms