Protein–RNA interactions for Protein: O54950

Prkag1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag1O54950 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Prkag1O54950 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Prkag1O54950 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Prkag1O54950 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Prkag1O54950 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Prkag1O54950 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Prkag1O54950 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Prkag1O54950 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Prkag1O54950 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Prkag1O54950 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Prkag1O54950 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Prkag1O54950 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Prkag1O54950 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Prkag1O54950 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Prkag1O54950 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Prkag1O54950 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Prkag1O54950 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Prkag1O54950 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Prkag1O54950 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Prkag1O54950 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Prkag1O54950 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Prkag1O54950 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Prkag1O54950 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Prkag1O54950 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Prkag1O54950 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Prkag1O54950 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Prkag1O54950 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Prkag1O54950 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Prkag1O54950 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Prkag1O54950 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Prkag1O54950 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Prkag1O54950 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Prkag1O54950 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Prkag1O54950 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Prkag1O54950 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Prkag1O54950 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Prkag1O54950 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Prkag1O54950 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Prkag1O54950 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Prkag1O54950 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Prkag1O54950 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms