Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Phox2bO35690 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phox2bO35690 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phox2bO35690 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phox2bO35690 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phox2bO35690 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phox2bO35690 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phox2bO35690 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phox2bO35690 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phox2bO35690 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phox2bO35690 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phox2bO35690 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phox2bO35690 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phox2bO35690 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Phox2bO35690 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phox2bO35690 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phox2bO35690 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Phox2bO35690 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phox2bO35690 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phox2bO35690 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phox2bO35690 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phox2bO35690 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phox2bO35690 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Phox2bO35690 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phox2bO35690 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phox2bO35690 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phox2bO35690 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phox2bO35690 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms