Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc18a3O35304 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc18a3O35304 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc18a3O35304 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc18a3O35304 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc18a3O35304 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc18a3O35304 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc18a3O35304 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms