Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpn9O35239 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpn9O35239 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn9O35239 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn9O35239 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn9O35239 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn9O35239 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ptpn9O35239 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptpn9O35239 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn9O35239 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn9O35239 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptpn9O35239 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ptpn9O35239 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ptpn9O35239 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpn9O35239 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn9O35239 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn9O35239 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn9O35239 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn9O35239 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn9O35239 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn9O35239 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpn9O35239 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptpn9O35239 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptpn9O35239 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptpn9O35239 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptpn9O35239 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpn9O35239 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn9O35239 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn9O35239 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpn9O35239 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn9O35239 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ptpn9O35239 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn9O35239 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn9O35239 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpn9O35239 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpn9O35239 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpn9O35239 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpn9O35239 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptpn9O35239 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpn9O35239 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpn9O35239 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpn9O35239 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptpn9O35239 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptpn9O35239 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptpn9O35239 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
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