Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pitx3O35160 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pitx3O35160 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx3O35160 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx3O35160 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitx3O35160 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pitx3O35160 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pitx3O35160 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pitx3O35160 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms