Protein–RNA interactions for Protein: O35126

Atn1, Atrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atn1O35126 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atn1O35126 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atn1O35126 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atn1O35126 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atn1O35126 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atn1O35126 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atn1O35126 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atn1O35126 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atn1O35126 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atn1O35126 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atn1O35126 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atn1O35126 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atn1O35126 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atn1O35126 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atn1O35126 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atn1O35126 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atn1O35126 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atn1O35126 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atn1O35126 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atn1O35126 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atn1O35126 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atn1O35126 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atn1O35126 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atn1O35126 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atn1O35126 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atn1O35126 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atn1O35126 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atn1O35126 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atn1O35126 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms