Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kif3cO35066 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Kif3cO35066 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kif3cO35066 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kif3cO35066 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kif3cO35066 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kif3cO35066 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kif3cO35066 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kif3cO35066 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kif3cO35066 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kif3cO35066 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kif3cO35066 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kif3cO35066 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kif3cO35066 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kif3cO35066 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kif3cO35066 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kif3cO35066 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kif3cO35066 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kif3cO35066 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kif3cO35066 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kif3cO35066 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kif3cO35066 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kif3cO35066 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kif3cO35066 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Kif3cO35066 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kif3cO35066 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kif3cO35066 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kif3cO35066 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms