Protein–RNA interactions for Protein: O08742

Gp5, Platelet glycoprotein V, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp5O08742 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gp5O08742 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gp5O08742 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gp5O08742 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gp5O08742 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gp5O08742 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gp5O08742 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gp5O08742 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gp5O08742 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gp5O08742 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gp5O08742 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gp5O08742 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gp5O08742 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gp5O08742 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp5O08742 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp5O08742 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gp5O08742 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gp5O08742 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gp5O08742 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gp5O08742 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gp5O08742 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gp5O08742 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gp5O08742 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gp5O08742 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gp5O08742 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gp5O08742 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gp5O08742 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gp5O08742 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gp5O08742 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gp5O08742 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gp5O08742 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gp5O08742 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gp5O08742 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gp5O08742 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gp5O08742 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gp5O08742 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gp5O08742 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gp5O08742 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gp5O08742 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gp5O08742 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gp5O08742 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gp5O08742 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gp5O08742 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms