Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Barx2O08686 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Barx2O08686 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Barx2O08686 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Barx2O08686 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Barx2O08686 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Barx2O08686 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Barx2O08686 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Barx2O08686 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Barx2O08686 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Barx2O08686 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Barx2O08686 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Barx2O08686 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Barx2O08686 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Barx2O08686 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Barx2O08686 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Barx2O08686 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Barx2O08686 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Barx2O08686 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Barx2O08686 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Barx2O08686 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Barx2O08686 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Barx2O08686 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Barx2O08686 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Barx2O08686 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Barx2O08686 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Barx2O08686 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Barx2O08686 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Barx2O08686 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Barx2O08686 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Barx2O08686 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Barx2O08686 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Barx2O08686 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Barx2O08686 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Barx2O08686 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Barx2O08686 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Barx2O08686 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Barx2O08686 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Barx2O08686 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Barx2O08686 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Barx2O08686 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Barx2O08686 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Barx2O08686 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Barx2O08686 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Barx2O08686 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Barx2O08686 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Barx2O08686 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Barx2O08686 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Barx2O08686 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Barx2O08686 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Barx2O08686 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Barx2O08686 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Barx2O08686 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Barx2O08686 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Barx2O08686 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Barx2O08686 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Barx2O08686 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Barx2O08686 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Barx2O08686 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Barx2O08686 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Barx2O08686 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Barx2O08686 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Barx2O08686 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Barx2O08686 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Barx2O08686 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Barx2O08686 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Barx2O08686 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Barx2O08686 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Barx2O08686 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Barx2O08686 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Barx2O08686 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Barx2O08686 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Barx2O08686 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Barx2O08686 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Barx2O08686 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Barx2O08686 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Barx2O08686 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Barx2O08686 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Barx2O08686 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms