Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec22bO08547 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sec22bO08547 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sec22bO08547 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sec22bO08547 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec22bO08547 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sec22bO08547 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sec22bO08547 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sec22bO08547 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sec22bO08547 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sec22bO08547 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sec22bO08547 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sec22bO08547 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sec22bO08547 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sec22bO08547 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sec22bO08547 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sec22bO08547 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sec22bO08547 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec22bO08547 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec22bO08547 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec22bO08547 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec22bO08547 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec22bO08547 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec22bO08547 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec22bO08547 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec22bO08547 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec22bO08547 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec22bO08547 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec22bO08547 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sec22bO08547 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec22bO08547 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec22bO08547 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sec22bO08547 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms