Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl4M0QW46 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ascl4M0QW46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ascl4M0QW46 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ascl4M0QW46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ascl4M0QW46 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ascl4M0QW46 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ascl4M0QW46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ascl4M0QW46 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ascl4M0QW46 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ascl4M0QW46 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ascl4M0QW46 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ascl4M0QW46 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ascl4M0QW46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ascl4M0QW46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.1 ms