Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r80L7N1Z3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r80L7N1Z3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r80L7N1Z3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r80L7N1Z3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r80L7N1Z3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r80L7N1Z3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r80L7N1Z3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r80L7N1Z3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r80L7N1Z3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r80L7N1Z3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r80L7N1Z3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r80L7N1Z3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r80L7N1Z3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r80L7N1Z3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r80L7N1Z3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r80L7N1Z3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r80L7N1Z3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r80L7N1Z3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r80L7N1Z3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms