Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vmn2r78K7N6U5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vmn2r78K7N6U5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vmn2r78K7N6U5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vmn2r78K7N6U5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vmn2r78K7N6U5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vmn2r78K7N6U5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vmn2r78K7N6U5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Vmn2r78K7N6U5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vmn2r78K7N6U5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Vmn2r78K7N6U5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vmn2r78K7N6U5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vmn2r78K7N6U5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vmn2r78K7N6U5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vmn2r78K7N6U5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vmn2r78K7N6U5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vmn2r78K7N6U5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vmn2r78K7N6U5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Vmn2r78K7N6U5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vmn2r78K7N6U5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vmn2r78K7N6U5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vmn2r78K7N6U5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn2r78K7N6U5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn2r78K7N6U5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vmn2r78K7N6U5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vmn2r78K7N6U5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vmn2r78K7N6U5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vmn2r78K7N6U5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vmn2r78K7N6U5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Vmn2r78K7N6U5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vmn2r78K7N6U5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vmn2r78K7N6U5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vmn2r78K7N6U5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vmn2r78K7N6U5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vmn2r78K7N6U5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vmn2r78K7N6U5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vmn2r78K7N6U5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn2r78K7N6U5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vmn2r78K7N6U5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vmn2r78K7N6U5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vmn2r78K7N6U5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vmn2r78K7N6U5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vmn2r78K7N6U5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vmn2r78K7N6U5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vmn2r78K7N6U5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms