Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21887J3QQ04 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21887J3QQ04 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21887J3QQ04 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21887J3QQ04 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm21887J3QQ04 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm21887J3QQ04 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms