Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm7971J3QMM8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm7971J3QMM8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm7971J3QMM8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm7971J3QMM8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm7971J3QMM8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm7971J3QMM8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm7971J3QMM8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm7971J3QMM8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm7971J3QMM8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm7971J3QMM8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm7971J3QMM8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm7971J3QMM8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm7971J3QMM8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm7971J3QMM8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm7971J3QMM8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm7971J3QMM8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm7971J3QMM8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm7971J3QMM8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm7971J3QMM8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7971J3QMM8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm7971J3QMM8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms