Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lipo1J3QME6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lipo1J3QME6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lipo1J3QME6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lipo1J3QME6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lipo1J3QME6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lipo1J3QME6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lipo1J3QME6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Lipo1J3QME6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lipo1J3QME6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lipo1J3QME6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Lipo1J3QME6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Lipo1J3QME6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lipo1J3QME6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lipo1J3QME6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lipo1J3QME6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lipo1J3QME6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lipo1J3QME6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lipo1J3QME6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lipo1J3QME6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lipo1J3QME6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lipo1J3QME6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Lipo1J3QME6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lipo1J3QME6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Lipo1J3QME6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lipo1J3QME6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lipo1J3QME6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Lipo1J3QME6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lipo1J3QME6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Lipo1J3QME6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lipo1J3QME6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lipo1J3QME6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lipo1J3QME6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lipo1J3QME6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lipo1J3QME6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Lipo1J3QME6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lipo1J3QME6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lipo1J3QME6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lipo1J3QME6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lipo1J3QME6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lipo1J3QME6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lipo1J3QME6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lipo1J3QME6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lipo1J3QME6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lipo1J3QME6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lipo1J3QME6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lipo1J3QME6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms