Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
7530416G11RikJ3QJX6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
7530416G11RikJ3QJX6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
7530416G11RikJ3QJX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
7530416G11RikJ3QJX6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
7530416G11RikJ3QJX6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
7530416G11RikJ3QJX6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms