Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r167G3UW71 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r167G3UW71 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r167G3UW71 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r167G3UW71 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r167G3UW71 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r167G3UW71 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r167G3UW71 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r167G3UW71 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r167G3UW71 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r167G3UW71 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r167G3UW71 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r167G3UW71 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r167G3UW71 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r167G3UW71 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r167G3UW71 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r167G3UW71 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r167G3UW71 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r167G3UW71 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r167G3UW71 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r167G3UW71 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r167G3UW71 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r167G3UW71 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r167G3UW71 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r167G3UW71 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r167G3UW71 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r167G3UW71 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r167G3UW71 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r167G3UW71 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r167G3UW71 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r167G3UW71 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r167G3UW71 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r167G3UW71 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r167G3UW71 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r167G3UW71 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r167G3UW71 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r167G3UW71 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r167G3UW71 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r167G3UW71 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r167G3UW71 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r167G3UW71 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r167G3UW71 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r167G3UW71 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms