Protein–RNA interactions for Protein: F7AXK2

Gm8871, Predicted pseudogene 8871 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8871F7AXK2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8871F7AXK2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8871F7AXK2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8871F7AXK2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8871F7AXK2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8871F7AXK2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8871F7AXK2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8871F7AXK2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8871F7AXK2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8871F7AXK2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8871F7AXK2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8871F7AXK2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8871F7AXK2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8871F7AXK2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8871F7AXK2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8871F7AXK2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8871F7AXK2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8871F7AXK2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8871F7AXK2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8871F7AXK2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8871F7AXK2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8871F7AXK2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8871F7AXK2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8871F7AXK2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8871F7AXK2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8871F7AXK2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8871F7AXK2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191 ms