Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm8220F6YKI2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8220F6YKI2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8220F6YKI2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8220F6YKI2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8220F6YKI2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8220F6YKI2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8220F6YKI2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8220F6YKI2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8220F6YKI2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8220F6YKI2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8220F6YKI2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8220F6YKI2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms