Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm10722F6VLK5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm10722F6VLK5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm10722F6VLK5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10722F6VLK5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10722F6VLK5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10722F6VLK5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10722F6VLK5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm10722F6VLK5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10722F6VLK5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10722F6VLK5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10722F6VLK5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm10722F6VLK5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm10722F6VLK5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm10722F6VLK5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm10722F6VLK5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm10722F6VLK5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm10722F6VLK5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm10722F6VLK5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm10722F6VLK5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm10722F6VLK5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm10722F6VLK5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm10722F6VLK5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm10722F6VLK5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm10722F6VLK5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm10722F6VLK5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm10722F6VLK5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10722F6VLK5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10722F6VLK5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms