Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M11F6U8V3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M11F6U8V3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M11F6U8V3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M11F6U8V3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M11F6U8V3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M11F6U8V3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M11F6U8V3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M11F6U8V3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-M11F6U8V3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M11F6U8V3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M11F6U8V3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M11F6U8V3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-M11F6U8V3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M11F6U8V3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M11F6U8V3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M11F6U8V3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-M11F6U8V3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-M11F6U8V3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-M11F6U8V3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M11F6U8V3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M11F6U8V3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M11F6U8V3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M11F6U8V3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M11F6U8V3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M11F6U8V3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M11F6U8V3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M11F6U8V3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M11F6U8V3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms