Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28305F6U473 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28305F6U473 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm28305F6U473 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28305F6U473 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28305F6U473 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms