Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
R3hdm1E9Q9Q2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
R3hdm1E9Q9Q2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
R3hdm1E9Q9Q2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
R3hdm1E9Q9Q2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
R3hdm1E9Q9Q2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
R3hdm1E9Q9Q2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3hdm1E9Q9Q2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
R3hdm1E9Q9Q2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
R3hdm1E9Q9Q2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
R3hdm1E9Q9Q2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
R3hdm1E9Q9Q2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
R3hdm1E9Q9Q2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
R3hdm1E9Q9Q2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3hdm1E9Q9Q2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3hdm1E9Q9Q2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3hdm1E9Q9Q2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3hdm1E9Q9Q2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
R3hdm1E9Q9Q2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3hdm1E9Q9Q2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3hdm1E9Q9Q2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
R3hdm1E9Q9Q2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
R3hdm1E9Q9Q2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3hdm1E9Q9Q2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3hdm1E9Q9Q2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3hdm1E9Q9Q2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3hdm1E9Q9Q2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3hdm1E9Q9Q2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3hdm1E9Q9Q2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3hdm1E9Q9Q2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
R3hdm1E9Q9Q2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3hdm1E9Q9Q2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3hdm1E9Q9Q2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3hdm1E9Q9Q2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3hdm1E9Q9Q2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3hdm1E9Q9Q2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3hdm1E9Q9Q2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3hdm1E9Q9Q2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3hdm1E9Q9Q2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3hdm1E9Q9Q2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3hdm1E9Q9Q2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3hdm1E9Q9Q2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3hdm1E9Q9Q2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3hdm1E9Q9Q2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3hdm1E9Q9Q2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3hdm1E9Q9Q2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
R3hdm1E9Q9Q2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
R3hdm1E9Q9Q2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3hdm1E9Q9Q2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3hdm1E9Q9Q2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3hdm1E9Q9Q2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.57■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3hdm1E9Q9Q2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3hdm1E9Q9Q2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3hdm1E9Q9Q2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3hdm1E9Q9Q2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
R3hdm1E9Q9Q2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
R3hdm1E9Q9Q2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms