Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Col22a1E9Q7P1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Col22a1E9Q7P1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Col22a1E9Q7P1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Col22a1E9Q7P1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Col22a1E9Q7P1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Col22a1E9Q7P1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Col22a1E9Q7P1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Col22a1E9Q7P1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Col22a1E9Q7P1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Col22a1E9Q7P1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Col22a1E9Q7P1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Col22a1E9Q7P1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Col22a1E9Q7P1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Col22a1E9Q7P1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col22a1E9Q7P1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Col22a1E9Q7P1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col22a1E9Q7P1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Col22a1E9Q7P1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col22a1E9Q7P1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col22a1E9Q7P1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Col22a1E9Q7P1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Col22a1E9Q7P1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Col22a1E9Q7P1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Col22a1E9Q7P1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Col22a1E9Q7P1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Col22a1E9Q7P1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Col22a1E9Q7P1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Col22a1E9Q7P1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Col22a1E9Q7P1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Col22a1E9Q7P1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Col22a1E9Q7P1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Col22a1E9Q7P1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Col22a1E9Q7P1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Col22a1E9Q7P1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Col22a1E9Q7P1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Col22a1E9Q7P1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Col22a1E9Q7P1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Col22a1E9Q7P1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Col22a1E9Q7P1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Col22a1E9Q7P1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Col22a1E9Q7P1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Col22a1E9Q7P1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Col22a1E9Q7P1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Col22a1E9Q7P1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Col22a1E9Q7P1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Col22a1E9Q7P1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Col22a1E9Q7P1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Col22a1E9Q7P1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Col22a1E9Q7P1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Col22a1E9Q7P1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Col22a1E9Q7P1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Col22a1E9Q7P1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Col22a1E9Q7P1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Col22a1E9Q7P1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Col22a1E9Q7P1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Col22a1E9Q7P1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Col22a1E9Q7P1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Col22a1E9Q7P1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Col22a1E9Q7P1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Col22a1E9Q7P1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Col22a1E9Q7P1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Col22a1E9Q7P1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Col22a1E9Q7P1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Col22a1E9Q7P1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Col22a1E9Q7P1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col22a1E9Q7P1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Col22a1E9Q7P1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Col22a1E9Q7P1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Col22a1E9Q7P1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms