Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm8882E9Q7E4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gm8882E9Q7E4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm8882E9Q7E4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm8882E9Q7E4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm8882E9Q7E4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm8882E9Q7E4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm8882E9Q7E4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm8882E9Q7E4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm8882E9Q7E4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm8882E9Q7E4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm8882E9Q7E4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm8882E9Q7E4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm8882E9Q7E4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm8882E9Q7E4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm8882E9Q7E4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm8882E9Q7E4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm8882E9Q7E4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm8882E9Q7E4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm8882E9Q7E4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm8882E9Q7E4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm8882E9Q7E4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm8882E9Q7E4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm8882E9Q7E4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm8882E9Q7E4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm8882E9Q7E4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm8882E9Q7E4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm8882E9Q7E4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm8882E9Q7E4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm8882E9Q7E4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm8882E9Q7E4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm8882E9Q7E4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm8882E9Q7E4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm8882E9Q7E4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm8882E9Q7E4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm8882E9Q7E4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm8882E9Q7E4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm8882E9Q7E4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm8882E9Q7E4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm8882E9Q7E4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm8882E9Q7E4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm8882E9Q7E4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm8882E9Q7E4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm8882E9Q7E4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm8882E9Q7E4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm8882E9Q7E4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm8882E9Q7E4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm8882E9Q7E4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm8882E9Q7E4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm8882E9Q7E4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm8882E9Q7E4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm8882E9Q7E4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm8882E9Q7E4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm8882E9Q7E4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm8882E9Q7E4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm8882E9Q7E4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm8882E9Q7E4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm8882E9Q7E4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm8882E9Q7E4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm8882E9Q7E4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm8882E9Q7E4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm8882E9Q7E4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm8882E9Q7E4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm8882E9Q7E4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm8882E9Q7E4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm8882E9Q7E4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm8882E9Q7E4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm8882E9Q7E4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm8882E9Q7E4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gm8882E9Q7E4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm8882E9Q7E4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm8882E9Q7E4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.4 ms