Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd2E9Q5F9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd2E9Q5F9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Setd2E9Q5F9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Setd2E9Q5F9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Setd2E9Q5F9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd2E9Q5F9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd2E9Q5F9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd2E9Q5F9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Setd2E9Q5F9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Setd2E9Q5F9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Setd2E9Q5F9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd2E9Q5F9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd2E9Q5F9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd2E9Q5F9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd2E9Q5F9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd2E9Q5F9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd2E9Q5F9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd2E9Q5F9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd2E9Q5F9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd2E9Q5F9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd2E9Q5F9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd2E9Q5F9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd2E9Q5F9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Setd2E9Q5F9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Setd2E9Q5F9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Setd2E9Q5F9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Setd2E9Q5F9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Setd2E9Q5F9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Setd2E9Q5F9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Setd2E9Q5F9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Setd2E9Q5F9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Setd2E9Q5F9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Setd2E9Q5F9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Setd2E9Q5F9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.7 ms