Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ApobE9Q414 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApobE9Q414 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApobE9Q414 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobE9Q414 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobE9Q414 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ApobE9Q414 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ApobE9Q414 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApobE9Q414 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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