Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930579F01RikE9Q3L6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930579F01RikE9Q3L6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930579F01RikE9Q3L6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930579F01RikE9Q3L6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930579F01RikE9Q3L6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930579F01RikE9Q3L6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930579F01RikE9Q3L6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930579F01RikE9Q3L6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930579F01RikE9Q3L6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930579F01RikE9Q3L6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms