Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8237E9Q257 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8237E9Q257 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm8237E9Q257 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8237E9Q257 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8237E9Q257 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8237E9Q257 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8237E9Q257 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8237E9Q257 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8237E9Q257 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8237E9Q257 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8237E9Q257 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8237E9Q257 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms