Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm20425E9Q035 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gm20425E9Q035 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20425E9Q035 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm20425E9Q035 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Gm20425E9Q035 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gm20425E9Q035 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm20425E9Q035 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm20425E9Q035 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm20425E9Q035 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm20425E9Q035 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm20425E9Q035 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gm20425E9Q035 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gm20425E9Q035 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm20425E9Q035 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gm20425E9Q035 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm20425E9Q035 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm20425E9Q035 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gm20425E9Q035 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm20425E9Q035 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gm20425E9Q035 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gm20425E9Q035 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gm20425E9Q035 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gm20425E9Q035 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Gm20425E9Q035 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm20425E9Q035 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Gm20425E9Q035 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gm20425E9Q035 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm20425E9Q035 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm20425E9Q035 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm20425E9Q035 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gm20425E9Q035 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gm20425E9Q035 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm20425E9Q035 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm20425E9Q035 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm20425E9Q035 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm20425E9Q035 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm20425E9Q035 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm20425E9Q035 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm20425E9Q035 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm20425E9Q035 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm20425E9Q035 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm20425E9Q035 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm20425E9Q035 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm20425E9Q035 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm20425E9Q035 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm20425E9Q035 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm20425E9Q035 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm20425E9Q035 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm20425E9Q035 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm20425E9Q035 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm20425E9Q035 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm20425E9Q035 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms