Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,27■■■■■ 4,2
Abca16E9PWJ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,26■■■■■ 4,2
Abca16E9PWJ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,26■■■■■ 4,2
Abca16E9PWJ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,26■■■■■ 4,2
Abca16E9PWJ7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,25■■■■■ 4,19
Abca16E9PWJ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,24■■■■■ 4,19
Abca16E9PWJ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41,23■■■■■ 4,19
Abca16E9PWJ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Abca16E9PWJ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Abca16E9PWJ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Abca16E9PWJ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Abca16E9PWJ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Abca16E9PWJ7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
Abca16E9PWJ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
Abca16E9PWJ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
Abca16E9PWJ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,16■■■■■ 4,18
Abca16E9PWJ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
Abca16E9PWJ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Abca16E9PWJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Abca16E9PWJ7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Abca16E9PWJ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,17
Abca16E9PWJ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,04■■■■■ 4,16
Abca16E9PWJ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC41,04■■■■■ 4,16
Abca16E9PWJ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,03■■■■■ 4,16
Abca16E9PWJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,03■■■■■ 4,16
Abca16E9PWJ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Abca16E9PWJ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Abca16E9PWJ7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
Abca16E9PWJ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4,15
Abca16E9PWJ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40,98■■■■■ 4,15
Abca16E9PWJ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,96■■■■■ 4,15
Abca16E9PWJ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40,94■■■■■ 4,15
Abca16E9PWJ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Abca16E9PWJ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
Abca16E9PWJ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Abca16E9PWJ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Abca16E9PWJ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Abca16E9PWJ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Abca16E9PWJ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Abca16E9PWJ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Abca16E9PWJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Abca16E9PWJ7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40,81■■■■■ 4,12
Abca16E9PWJ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Abca16E9PWJ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Abca16E9PWJ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC40,75■■■■■ 4,11
Abca16E9PWJ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Abca16E9PWJ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Abca16E9PWJ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Abca16E9PWJ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Abca16E9PWJ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Abca16E9PWJ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Abca16E9PWJ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Abca16E9PWJ7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40,66■■■■■ 4,1
Abca16E9PWJ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Abca16E9PWJ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40,65■■■■■ 4,1
Abca16E9PWJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Abca16E9PWJ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Abca16E9PWJ7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Abca16E9PWJ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40,59■■■■■ 4,09
Abca16E9PWJ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40,59■■■■■ 4,09
Abca16E9PWJ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Abca16E9PWJ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Abca16E9PWJ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Abca16E9PWJ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Abca16E9PWJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40,54■■■■■ 4,08
Abca16E9PWJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Abca16E9PWJ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40,53■■■■■ 4,08
Abca16E9PWJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Abca16E9PWJ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Abca16E9PWJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
Abca16E9PWJ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,48■■■■■ 4,07
Abca16E9PWJ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Abca16E9PWJ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40,47■■■■■ 4,07
Abca16E9PWJ7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Abca16E9PWJ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40,46■■■■■ 4,07
Abca16E9PWJ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40,46■■■■■ 4,07
Abca16E9PWJ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40,46■■■■■ 4,07
Abca16E9PWJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Abca16E9PWJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Abca16E9PWJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Abca16E9PWJ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC40,4■■■■■ 4,06
Abca16E9PWJ7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40,4■■■■■ 4,06
Abca16E9PWJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Abca16E9PWJ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,34■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40,32■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,32■■■■■ 4,05
Abca16E9PWJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40,31■■■■■ 4,04
Abca16E9PWJ7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,29■■■■■ 4,04
Abca16E9PWJ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Abca16E9PWJ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Abca16E9PWJ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms