Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Galntl6E5D8G1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Galntl6E5D8G1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Galntl6E5D8G1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Galntl6E5D8G1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Galntl6E5D8G1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Galntl6E5D8G1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Galntl6E5D8G1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Galntl6E5D8G1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Galntl6E5D8G1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Galntl6E5D8G1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Galntl6E5D8G1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Galntl6E5D8G1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Galntl6E5D8G1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Galntl6E5D8G1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Galntl6E5D8G1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Galntl6E5D8G1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms