Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm21560D3Z7A4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm21560D3Z7A4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm21560D3Z7A4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm21560D3Z7A4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm21560D3Z7A4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm21560D3Z7A4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm21560D3Z7A4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm21560D3Z7A4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm21560D3Z7A4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm21560D3Z7A4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21560D3Z7A4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21560D3Z7A4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21560D3Z7A4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21560D3Z7A4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21560D3Z7A4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21560D3Z7A4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21560D3Z7A4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21560D3Z7A4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21560D3Z7A4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21560D3Z7A4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm21560D3Z7A4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm21560D3Z7A4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21560D3Z7A4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21560D3Z7A4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21560D3Z7A4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21560D3Z7A4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21560D3Z7A4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21560D3Z7A4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms