Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms